Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt78E9Q0F0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt78E9Q0F0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms