Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Ddx60E9PZQ1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Ddx60E9PZQ1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Ddx60E9PZQ1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Ddx60E9PZQ1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms