Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms