Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms