Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms