Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms