Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms