Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc170D3YXL0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc170D3YXL0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc170D3YXL0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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