Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SafbD3YXK2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SafbD3YXK2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms