Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20547B8JJN0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20547B8JJN0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20547B8JJN0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20547B8JJN0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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