Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rd3lB2RV38 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms