Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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