Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms