Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ism1A2ATD1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ism1A2ATD1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ism1A2ATD1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ism1A2ATD1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ism1A2ATD1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ism1A2ATD1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ism1A2ATD1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ism1A2ATD1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ism1A2ATD1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ism1A2ATD1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ism1A2ATD1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ism1A2ATD1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ism1A2ATD1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms