Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Rtf1A2AQ19 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Rtf1A2AQ19 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Rtf1A2AQ19 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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