Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms