Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms