Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc183A2AJB1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc183A2AJB1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms