Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ambra1A2AH22 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ambra1A2AH22 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms