Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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