Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm4T1NXB5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms