Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms