Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms