Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ilf3Q9Z1X4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms