Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3b1Q9Z1T1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms