Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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Lgr5Q9Z1P4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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Lgr5Q9Z1P4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Lgr5Q9Z1P4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Lgr5Q9Z1P4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Lgr5Q9Z1P4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Lgr5Q9Z1P4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Lgr5Q9Z1P4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Lgr5Q9Z1P4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Lgr5Q9Z1P4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Lgr5Q9Z1P4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Lgr5Q9Z1P4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Lgr5Q9Z1P4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Lgr5Q9Z1P4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Lgr5Q9Z1P4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms