Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Cldn13Q9Z0S4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Cldn13Q9Z0S4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Cldn13Q9Z0S4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Cldn13Q9Z0S4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cldn13Q9Z0S4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cldn13Q9Z0S4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cldn13Q9Z0S4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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