Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13bQ9WU72 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms