Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam50bQ9WTJ8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam50bQ9WTJ8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms