Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zeb2Q9R0G7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms