Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek3Q9R0A5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms