Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a3Q9QZS0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a3Q9QZS0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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