Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ripk3Q9QZL0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ripk3Q9QZL0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ripk3Q9QZL0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms