Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc4Q9QZD4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms