Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms