Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms