Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hacd1Q9QY80 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hacd1Q9QY80 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms