Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Homer2Q9QWW1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms