Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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