Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc2lQ9JME7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms