Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms