Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdc42ep4Q9JM96 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc42ep4Q9JM96 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms