Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SrfQ9JM73 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SrfQ9JM73 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SrfQ9JM73 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SrfQ9JM73 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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