Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rabgef1Q9JM13 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rabgef1Q9JM13 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rabgef1Q9JM13 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rabgef1Q9JM13 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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