Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms