Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Col5a3Q9JLI2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Col5a3Q9JLI2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Col5a3Q9JLI2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms