Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l2Q9JLG4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms