Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms