Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hmgn5Q9JL35 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hmgn5Q9JL35 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hmgn5Q9JL35 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hmgn5Q9JL35 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hmgn5Q9JL35 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Hmgn5Q9JL35 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Hmgn5Q9JL35 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms