Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms